Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b1B1AZQ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms