Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms