Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a6B1AVK5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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