Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem238A9JSM3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms