Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samt1A2BED8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms