Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms