Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms