Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rtf1A2AQ19 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rtf1A2AQ19 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rtf1A2AQ19 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Rtf1A2AQ19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rtf1A2AQ19 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms