Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms