Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms