Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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