Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm27029A2A4P4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms