Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms