Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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