Protein–RNA interactions for Protein: A1EGX6

Fscb, Fibrous sheath CABYR-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FscbA1EGX6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FscbA1EGX6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FscbA1EGX6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms