Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trbv31A0A075B5J5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Trbv31A0A075B5J5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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