Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms