Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Krt27Q9Z320 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Krt27Q9Z320 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Krt27Q9Z320 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Krt27Q9Z320 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Krt27Q9Z320 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Krt27Q9Z320 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms