Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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