Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms