Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vamp5Q9Z2P8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms