Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms