Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms