Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms