Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms