Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ror1Q9Z139 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ror1Q9Z139 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms