Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VapaQ9WV55 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VapaQ9WV55 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VapaQ9WV55 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VapaQ9WV55 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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VapaQ9WV55 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapaQ9WV55 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms