Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabbr1Q9WV18 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms