Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip1Q9WUU8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms