Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn3Q9WUK7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms