Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn8aQ9WTU3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms