Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh13Q9WTR5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms