Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nek3Q9R0A5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nek3Q9R0A5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nek3Q9R0A5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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