Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmfrQ9R049 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms