Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Col4a3Q9QZS0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Col4a3Q9QZS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Col4a3Q9QZS0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Col4a3Q9QZS0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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