Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp21Q9QZL6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Usp21Q9QZL6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Usp21Q9QZL6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Usp21Q9QZL6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp21Q9QZL6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms