Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms