Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms