Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nphp1Q9QY53 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nphp1Q9QY53 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms