Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp3Q9QY23 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms