Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nufip1Q9QXX8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms