Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx8Q9QXV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms