Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms