Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Kcnip3Q9QXT8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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