Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms