Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall2Q9QX96 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall2Q9QX96 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms