Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms