Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms