Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms