Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms